Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFAP4Q01664 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP4Q01664 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms