Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTBN1Q01082 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTBN1Q01082 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms