Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VLDLRP98155 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms