Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB2P80303 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms