Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN10P78369 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN10P78369 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms