Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL38P63173 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL38P63173 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL38P63173 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL38P63173 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL38P63173 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL38P63173 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL38P63173 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL38P63173 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL38P63173 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL38P63173 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL38P63173 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL38P63173 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL38P63173 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL38P63173 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL38P63173 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL38P63173 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL38P63173 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL38P63173 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL38P63173 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL38P63173 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL38P63173 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL38P63173 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL38P63173 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms