Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS28P62857 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS28P62857 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS28P62857 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS28P62857 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS28P62857 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS28P62857 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms