Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSNL1P62760 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms