Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVPABLB-1P60509 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms