Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms