Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW4P57775 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW4P57775 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW4P57775 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW4P57775 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW4P57775 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW4P57775 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXW4P57775 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms