Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMDP57764 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms