Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BACE1P56817 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BACE1P56817 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BACE1P56817 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BACE1P56817 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BACE1P56817 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BACE1P56817 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BACE1P56817 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BACE1P56817 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BACE1P56817 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BACE1P56817 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BACE1P56817 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BACE1P56817 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BACE1P56817 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BACE1P56817 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BACE1P56817 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BACE1P56817 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BACE1P56817 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BACE1P56817 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms