Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC4P56524 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC4P56524 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC4P56524 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC4P56524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC4P56524 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC4P56524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms