Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC13P55735 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC13P55735 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC13P55735 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC13P55735 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC13P55735 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC13P55735 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC13P55735 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC13P55735 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC13P55735 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC13P55735 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC13P55735 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC13P55735 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC13P55735 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC13P55735 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC13P55735 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC13P55735 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms