Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP7P55210 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP7P55210 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP7P55210 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP7P55210 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP7P55210 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP7P55210 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP7P55210 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP7P55210 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP7P55210 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP7P55210 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP7P55210 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP7P55210 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP7P55210 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP7P55210 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP7P55210 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP7P55210 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP7P55210 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP7P55210 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP7P55210 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP7P55210 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP7P55210 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP7P55210 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms