Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRLP54845 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRLP54845 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRLP54845 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRLP54845 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NRLP54845 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRLP54845 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRLP54845 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRLP54845 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRLP54845 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRLP54845 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRLP54845 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRLP54845 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRLP54845 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRLP54845 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRLP54845 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRLP54845 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRLP54845 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRLP54845 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms