Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D1P54289 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms