Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATN1P54259 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATN1P54259 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATN1P54259 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATN1P54259 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATN1P54259 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATN1P54259 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATN1P54259 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATN1P54259 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATN1P54259 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATN1P54259 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATN1P54259 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATN1P54259 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATN1P54259 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATN1P54259 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATN1P54259 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATN1P54259 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATN1P54259 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms