Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN3P54252 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN3P54252 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN3P54252 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms