Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THOP1P52888 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THOP1P52888 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THOP1P52888 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
THOP1P52888 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THOP1P52888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THOP1P52888 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THOP1P52888 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THOP1P52888 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THOP1P52888 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THOP1P52888 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THOP1P52888 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THOP1P52888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THOP1P52888 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THOP1P52888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THOP1P52888 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THOP1P52888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THOP1P52888 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THOP1P52888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THOP1P52888 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THOP1P52888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THOP1P52888 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THOP1P52888 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms