Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR1P51861 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR1P51861 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR1P51861 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR1P51861 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR1P51861 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR1P51861 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR1P51861 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR1P51861 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR1P51861 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR1P51861 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR1P51861 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR1P51861 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR1P51861 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDR1P51861 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CDR1P51861 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR1P51861 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR1P51861 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR1P51861 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR1P51861 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR1P51861 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR1P51861 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR1P51861 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR1P51861 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR1P51861 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR1P51861 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR1P51861 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR1P51861 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR1P51861 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR1P51861 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR1P51861 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms