Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA4P51532 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA4P51532 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms