Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RORCP51449 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RORCP51449 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RORCP51449 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RORCP51449 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RORCP51449 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RORCP51449 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RORCP51449 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RORCP51449 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RORCP51449 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RORCP51449 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RORCP51449 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RORCP51449 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RORCP51449 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RORCP51449 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RORCP51449 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms