Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8P50990 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8P50990 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8P50990 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8P50990 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8P50990 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8P50990 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT8P50990 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8P50990 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8P50990 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8P50990 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8P50990 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8P50990 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8P50990 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT8P50990 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT8P50990 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT8P50990 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT8P50990 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT8P50990 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT8P50990 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT8P50990 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT8P50990 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT8P50990 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCT8P50990 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCT8P50990 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT8P50990 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT8P50990 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT8P50990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCT8P50990 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms