Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRIP1P50238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms