Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT3P49368 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT3P49368 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT3P49368 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT3P49368 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCT3P49368 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT3P49368 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT3P49368 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT3P49368 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCT3P49368 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCT3P49368 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCT3P49368 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms