Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A6P48664 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A6P48664 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms