Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV4P43268 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV4P43268 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV4P43268 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV4P43268 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV4P43268 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETV4P43268 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETV4P43268 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV4P43268 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV4P43268 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms