Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRATP43155 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRATP43155 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRATP43155 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRATP43155 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRATP43155 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRATP43155 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRATP43155 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRATP43155 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRATP43155 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRATP43155 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRATP43155 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRATP43155 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRATP43155 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRATP43155 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRATP43155 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRATP43155 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRATP43155 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms