Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGER3P43115 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms