Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL5P42830 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms