Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A1P41440 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms