Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 CLP1YOR250C 1338 nt5.7□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 HEM3YDL205C 984 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 URA3YEL021W 804 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 SCS2YER120W 735 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 YHR145CYHR145C 357 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 ATM1YMR301C 2073 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 MCH4YOL119C 1506 nt5.69□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 AIM10YER087W 1731 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 PRM1YNL279W 1986 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 ERD1YDR414C 1089 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 KTI12YKL110C 942 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 CCS1YMR038C 750 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 RAT1YOR048C 3021 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 NOT3YIL038C 2511 nt5.68□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 FHL1YPR104C 2811 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 HOR7YMR251W-A 180 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 NGL2YMR285C 1548 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 ADE4YMR300C 1533 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 RPN6YDL097C 1305 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 ACS2YLR153C 2052 nt5.67□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 SSK22YCR073C 3996 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 BRF1YGR246C 1791 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 IWR1YDL115C 1062 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 HSP31YDR533C 714 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 YLF2YHL014C 1218 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 MRPL39YML009C 213 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 YOR024WYOR024W 324 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 SRV2YNL138W 1581 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 MCM6YGL201C 3054 nt5.66□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 FUN19YAL034C 1242 nt5.65□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 YIF1YNL263C 945 nt5.65□□□□□ -1.5
YBL028CP38202 NTH2YBR001C 2343 nt5.65□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 NUP116YMR047C 3342 nt5.65□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 YAP1802YGR241C 1707 nt5.65□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.64□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 CUE5YOR042W 1236 nt5.64□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 UBA3YPR066W 900 nt5.64□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PZF1YPR186C 1290 nt5.64□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 HXT4YHR092C 1731 nt5.64□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 ARN2YHL047C 1863 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 YML131WYML131W 1098 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 SLD7YOR060C 774 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 OXP1YKL215C 3861 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 FOL1YNL256W 2475 nt5.63□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 SAF1YBR280C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 UBA1YKL210W 3075 nt5.62□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 YDL027CYDL027C 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PHO86YJL117W 936 nt5.62□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 JJJ3YJR097W 519 nt5.61□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PDI1YCL043C 1569 nt5.61□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 GDB1YPR184W 4611 nt5.61□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 MSS116YDR194C 1995 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 MAL11YGR289C 1851 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 RET1YOR207C 3450 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PWP1YLR196W 1731 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 TBF1YPL128C 1689 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PRS1YKL181W 1284 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 SCW10YMR305C 1170 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 DCI1YOR180C 816 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.6□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PRR1YKL116C 1557 nt5.59□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 PMA1YGL008C 2757 nt5.59□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 CBT1YKL208W 816 nt5.59□□□□□ -1.51
YBL028CP38202 ATE1YGL017W 1512 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 KCH1YJR054W 1494 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 ZUO1YGR285C 1302 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 CAB1YDR531W 1104 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 NOP16YER002W 696 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 COX18YGR062C 951 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 PXR1YGR280C 816 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 MVD1YNR043W 1191 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YPL199CYPL199C 723 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 NOP7YGR103W 1818 nt5.58□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 DBF2YGR092W 1719 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 CNM67YNL225C 1746 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 SNF3YDL194W 2655 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 NQM1YGR043C 1002 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YPL191CYPL191C 1083 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 TUP1YCR084C 2142 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 DOA1YKL213C 2148 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 PDR10YOR328W 4695 nt5.57□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 AIM17YHL021C 1398 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 AFT1YGL071W 2073 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YJU2YKL095W 837 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 HOF1YMR032W 2010 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 HAP1YLR256W 4509 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YNL247WYNL247W 2304 nt5.56□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 FUI1YBL042C 1920 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YGL185CYGL185C 1140 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 CKA2YOR061W 1020 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 PTK2YJR059W 2457 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 SSZ1YHR064C 1617 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 GAS3YMR215W 1575 nt5.55□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 ECM7YLR443W 1347 nt5.54□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 YEF1YEL041W 1488 nt5.54□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 NGR1YBR212W 2019 nt5.54□□□□□ -1.52
YBL028CP38202 ARB1YER036C 1833 nt5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms