Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC1P36383 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC1P36383 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC1P36383 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJC1P36383 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJC1P36383 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC1P36383 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC1P36383 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC1P36383 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJC1P36383 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJC1P36383 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJC1P36383 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJC1P36383 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJC1P36383 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJC1P36383 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJC1P36383 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJC1P36383 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJC1P36383 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJC1P36383 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms