Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX5P35711 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX5P35711 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX5P35711 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX5P35711 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX5P35711 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX5P35711 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX5P35711 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX5P35711 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX5P35711 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX5P35711 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms