Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB2P35606 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB2P35606 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB2P35606 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB2P35606 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB2P35606 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB2P35606 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB2P35606 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB2P35606 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB2P35606 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB2P35606 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB2P35606 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB2P35606 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB2P35606 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB2P35606 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB2P35606 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB2P35606 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB2P35606 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB2P35606 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPB2P35606 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPB2P35606 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms