Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNB1P35222 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNB1P35222 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms