Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA1P35221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNA1P35221 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms