Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFN2P35080 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFN2P35080 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFN2P35080 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFN2P35080 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFN2P35080 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFN2P35080 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFN2P35080 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFN2P35080 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFN2P35080 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFN2P35080 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFN2P35080 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms