Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH5P33151 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH5P33151 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH5P33151 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH5P33151 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH5P33151 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH5P33151 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH5P33151 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH5P33151 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH5P33151 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH5P33151 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH5P33151 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH5P33151 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH5P33151 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH5P33151 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH5P33151 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH5P33151 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH5P33151 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH5P33151 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH5P33151 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH5P33151 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH5P33151 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH5P33151 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH5P33151 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH5P33151 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH5P33151 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH5P33151 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH5P33151 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH5P33151 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH5P33151 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms