Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC8P31273 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 874.8 ms