Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC25CP30307 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC25CP30307 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms