Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRABP2P29373 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRABP2P29373 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRABP2P29373 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms