Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB2P29033 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB2P29033 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB2P29033 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB2P29033 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB2P29033 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB2P29033 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB2P29033 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB2P29033 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB2P29033 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB2P29033 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB2P29033 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB2P29033 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB2P29033 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB2P29033 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB2P29033 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB2P29033 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB2P29033 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB2P29033 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB2P29033 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB2P29033 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB2P29033 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB2P29033 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB2P29033 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB2P29033 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB2P29033 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB2P29033 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB2P29033 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB2P29033 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB2P29033 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB2P29033 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB2P29033 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB2P29033 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB2P29033 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB2P29033 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms