Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD1P28289 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD1P28289 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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