Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD3P28288 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD3P28288 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD3P28288 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD3P28288 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD3P28288 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD3P28288 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCD3P28288 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD3P28288 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD3P28288 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD3P28288 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD3P28288 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms