Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2AP24928 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2AP24928 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
POLR2AP24928 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2AP24928 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2AP24928 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2AP24928 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2AP24928 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2AP24928 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2AP24928 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2AP24928 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2AP24928 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2AP24928 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2AP24928 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2AP24928 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR2AP24928 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR2AP24928 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.51■■■□□ 2
POLR2AP24928 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms