Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACBP22694 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKACBP22694 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms