Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH3P22223 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH3P22223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH3P22223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH3P22223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH3P22223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH3P22223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH3P22223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH3P22223 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH3P22223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH3P22223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH3P22223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH3P22223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH3P22223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH3P22223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH3P22223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH3P22223 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH3P22223 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH3P22223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH3P22223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH3P22223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms